華為Mate40搭載的是麒麟9000E處理器，該處理器與麒麟9000相比，主要在CPU以及GPU上有所減配，但是麒麟9000E芯片的綜合表現(xiàn)依然強悍，依然屬于旗艦級別的芯片。麒麟9000E這顆處理器同樣使用的是5nm制程工藝，相比于7納米制程工藝性能上有著非常大的升級。其中CPU主頻最高能達到3.13GHz， GPU為22核心的Mali-G78，另外還有華為資源的NPC核心，總之這顆芯片也是屬于旗艦級別的水準。

從參數(shù)上，根據(jù)官方的說法，麒麟9000E相比麒麟9000，在GPU方面，從24核G78降為22核G78，雙大核NPU降為一大核NPU。而從參數(shù)上來看可能并不夠直觀，那么就是跑分來看吧，Mate40 Pro跑分可達9065，Mate40標準版也達到了8771。這意味著什么呢?也就是說，放到日常生活中體驗的話，由于兩者的CPU是一樣的，所以可以說用戶根本感受不到性能的差異。

而對此，余承東也曾表示，因為麒麟9000的NPU和GPU性能遙遙領先同行，所以麒麟9000E的性能也明顯領先同行?！坝脩羰褂脮r，這兩個沒有什么區(qū)別，性能都超出了你的使用要求?！?